被劫持的列车在大雨之夜高速行驶着，乔丽娜和戴明珠拿着冷坚、程一鸣逃离特种车时丢弃的防毒面具来到关人质的5号车厢，她以枪杀3名人质为要挟，要防毒面具的主人自认。列车长在危机时刻出面阻止无效，吴刚挺身而出，机智地化解了危机，保护了人质的生命安全。
被劫持的列车于凌晨驶过戒备森严的金城车站。"蓝剑"特种部队的20名士兵在指挥官王飞的带领下乘坐两架远程直升飞机奉命赶到宾州。章铁林命令一架直升机在宾州待命，另一架紧紧咬住高速行驶的列车，他则紧急飞到宾州。经过缜密的分析，他判断列车到达宾州后不会进入京广铁路，而是要进入宾黔铁路。因宾黔铁路不是电气铁路，恐怖分子肯定会以处死人质和炸毁列车为由，要挟更换内燃机车，便在下达警戒命令的同时，命令铁路部门准备内燃机车。
果然，列车到达宾州后停车了，乔丽娜提出在释放部分人质的前提下要求更换内燃机车，开通宾黔铁路。章铁林在释放更多人质的要求得到满足后，给列车更换了机车。恐怖分子在释放了包括全体乘务员（列车长除外）在内的141名人质后，列车驶上了宾黔铁路。
国家反恐总局局长陆大川乘专机赶到宾州，章铁林向他汇报了当前的情况，并报告已命令王飞到宾黔铁路沿线查看地形，准备发动攻击。但是，另一个情报使得他们很意外，这就是从被释放的人质口中得知列车上还有一股势力——盗窃集团，他们很可能要面对两股邪恶势力。陆大川同意发动攻击，并命令章铁林全权负责这一突发事件的处理。
"蓝剑"突击队决定在一座隧道口发动攻击。但是，他们不知道一开始就识破冷坚等人身份的吴刚已通过特殊手段控制了冷坚等人，并说服他们一起从列车内部动手，解决身处的困境。吴刚用一种极其特别的方法向外面发出了信息，通报了自己的身份和决定在列车内采取行动。蓝剑突击队按计划发动了攻击，突然而来的大雨严重干扰了他们的行动，两名突击队员从隧道口上跳向列车顶部时摔下列车，一名队员撞上车门，引爆了炸弹，将列车尾部两节车厢的连接处炸开一个大豁口。王飞和两名队员跳进豁口，强行发动攻击，一场激烈的枪战打响了，枪战中他们击毙了苏克。陈文龙引爆了7号车厢与8号车厢连接处的炸弹，列车后部的8—10号车厢被炸翻到铁路路基下，突击队员一死五伤，攻击失败了。