- 001 初始（上）
- 002 初始（下）
- 003 任务开始
- 004 列车里的变故
- 005 任务进行时
- 006 生死之间（上）
- 007 生死之间（下）
- 008 逃出生天
- 009 到达主机房 上
- 010 到达主机房 下
- 011 改变的剧情 上
- 012 改变的剧情 下
- 013 兵分两路
- 014 下水道惊魂
- 015 变异（上）
- 016 变异（下）
- 017 新生
- 018 终回列车
- 019 回归
- 020 抉择
- 021 强化（上）
- 022 强化（中）
- 023 强化（下）
- 024 训练
- 025 回归原点（上）
- 026 回归原点（下）
- 第二卷 开始—再次进入
- 028 新人
- 029 没有任务？
- 030 试验
- 031 初见克罗斯
- 032 意外的战斗 上
- 033 意外的战斗 下
- 034 生死边缘
- 035 任务开始
- 036 医疗室
- 037 石金？石晶！
- 038 支线任务（上）
- 039 支线任务（下）
- 040 擒贼先擒王
- 041 训练
- 042 正中红心
- 043 B计划（上）
- 044 B计划（下）
- 045 惊人变故
- 046 觉醒
- 047 逃生（上）
- 048 逃生（下）
- 49 活着比什么都重要
- 050 新的认识(上）
- 051 新的认识（下）
- 052 突入
- 053 再见X先生们
- 054 回归
- 056 强化
- 057 讨论（上）
- 058 讨论（下）
- 059 科技路线（上）
- 060 科技路线（下）
- 061 小女孩
- 62 黑客帝国准备开始
- 第三卷 开始——新人 上
- 063 新人（下）
- 064 准备好了吗？
- 065 初会史密斯
- 066 会升级的敌人
- 067 守护天使（上）
- 068 守护天使（下）
- 069 需要时间
- 070 等待
- 071 这是我们的生活
- 072 救援墨菲斯
- 073 吸收
- 074 加强版特工
- 075 飞
- 076 新的能力
- 077 断后
- 078 这是我的选择
- 079 大胆的试验
- 080 失去视觉
- 081 数据眼
- 082 自责
- 083 心魔（上）
- 084 心魔（下）
- 085 初见尼奥
- 086 有惊无险
- 087 核心中的电影
- 088 重新选择的机会
- 089 压力
- 090 选择在你
- 091 花瓶
- 092 初见先知
- 093 真实的自我
- 094 修改
- 95 让上天来保佑我们
- 096 准备战斗
- 097 任务分配
- 098 战斗开始
- 099 战斗进行时
- 100 没有意外
- 101 一切都在计划中
- 102 计划继续进行
- 103 公路逃生（上）
- 104 公路逃生（中）
- 105 公路逃生（下）
- 106 治疗失败
- 107 转移目标（上）
- 108 转移目标（下）
- 109 劣势
- 110 逆转
- 111 改变计划
- 112 研究AT力场
- 113 出乎意料
- 114 终于回归
- 115 回归
- 116 劝解
- 117 任务讨论
- 118 新的队员
- 2012准备开始
- 第四卷 开始 主神语
- 121 特殊的新人
- 122 难以作出的选择
- 123 信任与选择
- 124 其他的轮回者
- 125 初次交锋
- 126 暂时脱险
- 第一节休息
- 128 特殊视觉
- 129 混乱
- 130 长门有希
- 131 特殊的队伍（上
- 132 特殊的队伍 下
- 133 开始行动
- 134 阻拦
- 135 准备起飞
- 136 起飞
- 137 共享
- 138 不完美的成功
- 139 遇袭
- 140 反击（上）
- 141 反击（下）
- 142 风云突变
- 143 凌风
- 144 有惊无险
- 145 不一样的轮回者
- 146 终到方舟
- 147 回到方舟
- 148 审判者降临
- 149 修复方舟
- 150 不违背自己的心
- 151 阻挡海啸
- 152 初见审判者
- 153 杨林之死
- 154 峰回路转
- 155 有价值的人
- 156 长门的去留
- 157 安全回归
- 158 玉简
- 159 如何面对
- 160 强化武器
- 第五卷 回归原来的世界
- 162 复仇
- 163 必须要做的事情
- 164 教室里的冲突
- 165 寻人
- 166 去往目的地
- 167 进化试验
- 168 会和
- 169集 会
- 170 复杂的关系
- 171 梦中的会议
- 172 逃离程序
- 173 回国
- 174 因与果
- 175 最后的准备
- 176 试验开始
- 177 搜索幸存者
- 178 接触幸存者
- 179 记忆修改之后
- 180 逃离学校
- 181 撤离点
- 182 隔离时间
- 183 变异丧尸的进攻
- 184 惊变
- 185 失守
- 186 最后的抵抗
- 187 救世主小队确认
- 188 修改规则
- 189 危险来临
- 190 走自己的路